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Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  30 lines
  1. **********************************************
  2. * cAMP phosphodiesterases class-II signature *
  3. **********************************************
  4.  
  5. Cyclic  AMP  phosphodiesterase   (EC 3.1.4.17)  (cAMP-PDEase)   catalyzes  the
  6. hydrolysis of  cAMP to  the  corresponding nucleoside 5' monophosphate.  While
  7. most PDEases can be, on  the  basis of sequence similarities, grouped together
  8. [1], there are at least two enzymes which do not  belong to the main family of
  9. PDEases and which represent a second class of these enzymes [2]:
  10.  
  11.  - Slime mold Dictyostelium discoideum extracellular cAMP PDEase.  This enzyme
  12.    plays an essential role in  development  by  hydrolyzing the cAMP used as a
  13.    chemoattractant by aggregating cells.
  14.  - Budding yeast and Candida albicans low-affinity cAMP PDEase (gene PDE1).
  15.  - Fission yeast probable cAMP PDEase (gene cgs2).
  16.  
  17. There is, in the central part of  these enzymes,  a  highly  conserved  region
  18. which contains three histidines.  We  have  used  this  region  as a signature
  19. pattern.
  20.  
  21. -Consensus pattern: H-x-H-L-D-H-[LIVM]-x-[GS]-[LIVMA]-[LIVM](2)-x-S-[AP]
  22. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  23. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  24. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  25.  
  26. [ 1] Beavo J.A., Reifsnyder D.H.
  27.      Trends Pharmacol. Sci. 11:150-155(1990).
  28. [ 2] Nikawa J.-I., Sass P., Wigler M.
  29.      Mol. Cell. Biol. 7:3629-3636(1987).
  30.